Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rbbp4Q60972 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms