Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc85aQ5SP85 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc85aQ5SP85 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc85aQ5SP85 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc85aQ5SP85 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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