Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Trappc1Q5NCF2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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