Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim41Q5NCC3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms