Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrfip1Q3UZ39 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms