Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C87499Q3UX49 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms