Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms