Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm5460Q3UQ97 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm5460Q3UQ97 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm5460Q3UQ97 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm5460Q3UQ97 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5460Q3UQ97 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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