Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsponQ3UPR9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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