Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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