Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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