Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms