Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tmem253Q3UNB8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tmem253Q3UNB8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmem253Q3UNB8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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