Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms