Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms