Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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