Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf180Q3U827 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms