Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q3U6N9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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