Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q3U595 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q3U595 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q3U595 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q3U595 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms