Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms