Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms