Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
InipQ3TXT3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
InipQ3TXT3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms