Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms