Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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