Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb38Q3LR78 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb38Q3LR78 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms