Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms