Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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Shroom4Q1W617 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Shroom4Q1W617 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Shroom4Q1W617 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Shroom4Q1W617 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Shroom4Q1W617 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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