Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Samd11Q1RNF8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms