Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Traf3ip1Q149C2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Traf3ip1Q149C2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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Traf3ip1Q149C2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Traf3ip1Q149C2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Traf3ip1Q149C2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Traf3ip1Q149C2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Traf3ip1Q149C2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Traf3ip1Q149C2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Traf3ip1Q149C2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf3ip1Q149C2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Traf3ip1Q149C2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms