Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Spatc1Q148B6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Spatc1Q148B6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms