Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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VgfQ0VGU4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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VgfQ0VGU4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VgfQ0VGU4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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VgfQ0VGU4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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VgfQ0VGU4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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VgfQ0VGU4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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VgfQ0VGU4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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VgfQ0VGU4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VgfQ0VGU4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms