Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms