Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cntnap5cQ0V8T7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cntnap5cQ0V8T7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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