Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TrioQ0KL02 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms