Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms