Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Calb2Q08331 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Calb2Q08331 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Calb2Q08331 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Calb2Q08331 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb2Q08331 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Calb2Q08331 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.6 ms