Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms