Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxcr5Q04683 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxcr5Q04683 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxcr5Q04683 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxcr5Q04683 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxcr5Q04683 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxcr5Q04683 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cxcr5Q04683 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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