Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb4Q02738 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb4Q02738 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms