Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax5Q02650 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms