Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms