Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms