Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2aQ01320 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms