Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelpQ01102 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SelpQ01102 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelpQ01102 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelpQ01102 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelpQ01102 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelpQ01102 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelpQ01102 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelpQ01102 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelpQ01102 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelpQ01102 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelpQ01102 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelpQ01102 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms