Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grin2bQ01097 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms