Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gabpb1Q00420 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabpb1Q00420 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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