Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lama4P97927 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lama4P97927 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms