Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms