Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rad50P70388 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms