Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pkn1P70268 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pkn1P70268 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pkn1P70268 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Pkn1P70268 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pkn1P70268 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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